İstanbul 29 Mayıs Üniversitesi Sosyal Bilimler Enstitüsü 24 Nisan 2010 tarihinde kuruldu ve geleceğin akademisyenlerini yetiştirmede ciddi bir paya sahip olmak için 2012-2013 akademik yılından itibaren faaliyete geçti. Enstitümüzde 2015 -2016 Eğitim-Öğretim yılı itibarıyla 9 Anabilim Dalına bağlı 9’u tezli, 7’si tezsiz  toplam 16 yüksek lisans  programı ile 5 doktora programına öğrenci kabul ediliyor.